การเปลี่ยนแปลงหลายอย่างภายในร่างกายคนท้อง เป็นสาเหตุของอาการปวดหัว เช่น ปริมาณเลือดที่เพิ่มสูงขึ้น เลือดไหลเวียนในร่างกายคนท้องมากขึ้น ฮอร์โมนที่เริ่มทำงานกันอย่างเมามัน ฮอร์โมนเหล่านี้คือสิ่งที่ทำให้แม่มีขนเยอะ อารมณ์แปรปรวน การขาดวิตามินบางชนิดก็อาจทำให้เกิดอาการปวดหัวได้เช่นกัน